С 2006 года мумитролльцы принимают участие в НАЭ – Новгородской археологической экспедиции.
В ноябре 2005 г. в «Муми-Тролле» впервые читал лекцию академик Андрей Анатольевич Зализняк. За чаем после лекции Андрей Анатольевич рассказывал о Новгородской археологической экспедиции МГУ и о том, как нуждается она в энтузиастах, готовых работать на раскопках. Варвара Михайловна Михина (учитель истории младшей школы) узнала у Андрея Анатольевича, с кем можно связаться, чтобы приезжать на раскоп с учениками, и тем самым стала зачинателем новой школьной традиции.
Первая же поездка получилась замечательной! Из Великого Новгорода было привезено множество впечатлений, фотографий и, безусловно, новых знаний в области археологии и истории. Школьники и взрослые полдня работали на раскопе вместе со студентами-историками и настоящими учёными, знакомились со всеми этапами работы археологов, историков, лингвистов, реставраторов. В оставшееся время ходили на лекции, в музеи, ездили на экскурсии, катались на теплоходике, загорали на берегу Волхова или просто гуляли по необыкновенно уютным улочкам Старого города.
С тех пор «Муми-Тролль» организует поездки в Великий Новгород практически каждое лето.