История школы «Муми-Тролль» берет свое начало в далеком 1990 году, когда основатели школы Екатерина Михайловна Марьямова и Андрей Борисович Ильичев организовали маленькую частную школу, выросшую из такого же маленького семейного детского сада.
В сентябре 1991 года школа получила помещение на Волоколамском шоссе, д.1 и школа зажила новой жизнью.
Школа росла, каждый год появлялся новый класс, мумитролльцев становилось все больше и больше. Осенью 1993 года у школы появилось второе здание, а в 2003г. 1–6 классы переехали в Новогорск. Школа «Муми-Тролль» официально разделилась на две школы.
В 1998 году состоялся первый выпуск школы, а в 2024 году прошел уже 23-й выпускной вечер.